Belangrijkste kenmerken van FreeCommander:

• Dual-panel technologie – horizontaal en verticaal (ook één paneel mogelijk)
• Interface met tabbladen
• Volledige toegang tot desktop
• Optionele boomstructuur voor elk paneel
• Ingebouwde bestandsviewer om bestanden in hexadecimale, binaire, tekst- of afbeeldingsindeling te bekijken
• Bestandsviewer en miniatuurweergave ook in archieven
• Ingebouwde archiefverwerking: ZIP (lezen, schrijven)
• Geneste archiefverwerking
• Plugins voor ander archief (RAR, 7z, …)
• Duidelijke weergave – structuurloze weergave voor bestanden en mappen
• Gelinkt browsen
• Gemakkelijke toegang tot systeemmappen, configuratiescherm, bureaublad en startmenu
• Kopieer, verplaats, verwijder, hernoem bestanden en mappen (alternatief als Windows- of FreeCommander-bewerking)
• Slepen, laten vallen
• Bestanden zoeken (ook binnen archief)
• Zoeken naar duplicaten
• Maak en verifieer MD5- en SHA-controlesommen
• Bestanden wissen
• Tool voor meerdere hernoemen
• Paden langer dan 255 tekens kunnen worden geopend, gekopieerd, verplaatst en hernoemd
• Bestandseigenschappen en contextmenu
• Berekening van mapgrootte
• Map vergelijking
• Mapsynchronisatie
• Wijziging van bestandsdatum en attributen
• Favorieten van mappen/programma’s
• Bestandsfilters (regexp ook mogelijk) voor weergave- en bestandsbewerkingen
• Door de gebruiker gedefinieerde kolommen voor gedetailleerde weergaven
• Automatische weergaven
• Eenvoudige FTP/SFTP-client (alleen SFTP 64 bit)
• Toegang tot mobiele apparaten (bijv. smartphones, tablets)
• DOS-opdrachtregel
• Snelle kijker
• Snelzoeken
• Snel filter
• Snelle starter
• Desktop-snapshots
• Alle sneltoetsen zijn definieerbaar
• Flexibele configuratie van bijna alle functies
• Kleurenschema’s
• Ondersteuning voor meerdere talen